首先应到医院查明畸形精子出现的原因。出现畸形精子症的病因非常多，有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，它们均可导致畸形精子增加。患者染色体异常以可能导致精子畸形率升高。由感染引起的患者可进行抗炎治疗；由内分泌异常所致者，则给予内分泌功能调整；对精索静脉曲张者，应考虑手术治疗。若确诊为染色体病，则治疗困难，可通过精液培养，人工授精等方式改善不孕情况。