食管炎的发生与多种因素有关，很多的损伤因素都可以引起食管炎，常见的有物理化学因素，生物因素，免疫因素等。物理因素指坚硬的食物或过热的食物以及误服的骨头等引起的划伤及擦伤，同时合并吞咽，呕吐动作加重损伤；化学因素如酸碱等药物损伤食管黏膜引起食管炎，自发的反流性食管炎则与胃酸反流有关；生物因素指病原微生物感染引起，如金黄色葡萄球菌，真菌感染，这种情况很多是在化疗，放疗，以及应用广谱抗菌素时出现。