磷霉素氨丁三醇散治疗尿路感染效果是比较好的，磷霉素是种相对比较新的抗生素，对常见的尿路致病菌，包括大肠杆菌、克雷伯杆菌、肠球菌、绿脓杆菌，以及链球菌、支原体、衣原体等都具有一定的疗效，耐药率比较低。
特别是对于喹诺酮类以及头孢菌素类应用比较多的患者，出现耐药的人效果也非常好。磷霉素氨丁三醇散具有副作用比较轻的优点，只有少数人吃完以后会出现大便变稀的现象，优点是老人、儿童、孕妇等都可以使用。在中国泌尿外科疾病诊疗指南中，也推荐磷霉素氨丁三醇散作为泌尿系感染治疗的一线用药。