多发性硬化症的确诊，需要根据客观病史和临床体征为基本依据，充分结合辅助检查，特别是磁共振检查的特点，寻找病变的空间多发性和时间多发性的证据。同时，还需要排除其它可能的疾病。
临床表现上大于等于两次的临床发作，客观临床证据提示存在大于等于两个不同中枢神经系统部位的病灶患者，可考虑确诊多发性硬化症。确诊的同时，需注意排除多发性腔隙性脑梗塞、脑白质营养不良、原发性中枢神经系统淋巴瘤，以及脊髓肿瘤等其他疾病。