肾积水晚上疼痛加剧的主要原因，是由于以下方面：
1、对于肾积水的患者，尤其是轻中度的肾积水，可以进行日常的生活和工作。白天由于工作和生活比较繁忙，没有关注到肾区的疼痛，而夜间睡眠后夜深人静，关注到肾区出现了不适，可能会越来越明显。
2、由于晚上睡眠后尿量的减少，使得肾积水不及白天可以达到一定的缓解，从而引起晚上的疼痛明显。
3、最主要的原因仍然是由于夜间睡眠后有小的结石，通过输尿管排出机体，刺激而引起了明显的疼痛。
对于肾积水导致的夜间疼痛，需要进行急诊的处理，观察肾积水等原因是否由于结石堵塞或者其他的炎症反应引起，而进行紧急的处理。