多指畸形的手术时机需要根据多指的结构而确定。小的赘生物可以早期切除，在小儿3-4岁以后做韧带肌腱手术比较适合，同时可以配合手术进行功能锻炼。
如果需要做骨骼矫形手术，建议等到小儿骨骼发育基本停止后再做手术。
但多指畸形对小儿的手部功能和心理发育有一定影响，所以一般建议在学龄前手术，需要截骨的部位应避开骨骺线，属于分叉畸形应联通部分骨骺一并切除。