小儿乳糜泻主要是由于遗传因素、食物因素引起的，好发人群是直系亲属中患有乳糜泻者、麸质过敏者。
1、遗传因素：该病为遗传病，根据遗传病学，该病可由父母遗传给子女，因此父母或者其他直系亲属患有该病容易遗传。
2、食物因素：麸质是一种复合型植物蛋白，在小麦、黑麦、大麦等食品中都存在，该蛋白可以分解成四种蛋白质，患者会对其过敏，不可完全吸收。