气管肿瘤的治疗原则主要以手术治疗为主，辅助药物治疗和放射治疗。常用的药物治疗有干扰素和阿地白介素，该病需要长期持续性治疗。
一、药物治疗
1、干扰素：是一种由单核细胞和淋巴细胞产生的细胞因子，干扰素通过增强自然杀伤细胞的活性以及对肿瘤的细胞毒作用，抑制肿瘤细胞的分裂，是治疗转移性肾癌有效的方法。不良反应有发热、头痛、白细胞数量下降等，过敏者禁用。
2、阿地白介素(IL-2)：免疫调节物。免疫细胞被激活后产生的一种细胞因子。参与神经内分泌功能的调节。在淋巴细胞间传递信息，调节淋巴细胞或其他前体细胞的生长和分化。可影响造血功能和免疫功能，并维持机体的稳定。常有胃肠道反应表现为恶心、呕吐、腹泻等。
二、手术治疗
气管肿瘤切除术，该手术目的是完全切除肿瘤，永久解除气道梗阻，达到长期生存的目的。可依据患者自身情况，选择上段气管切除、喉-气管切除、袖式气管切除、隆突切除重建或隆突－肺联合切除术。该手术禁忌症包括气管周围大量转移性淋巴结，气管受侵长度大于气管长度的50%。侵犯纵隔不可切除的脏器血管，纵隔既往曾接受超过60Gy剂量的放疗或曾接受手术切除，气管鳞癌出现远处转移。
三、放射治疗
对于不可切除的患者，放疗可作为姑息治疗和减症手段。对于手术未能根治切除的患者，术后可予放射照射。这一治疗模式可杀灭气管鳞癌或腺样囊性癌术后瘤床和区域淋巴结的残余病灶。该治疗照射范围是肿瘤术前的范围必须包括在照射野内并外放1~2cm，上下界根据肿瘤的浸润程度外放2~3cm，但是对气管腺样囊性癌必须考虑肿瘤黏膜下转移及周围侵犯，所以上下界照射野要足够。
四、其他治疗
1、放射治疗：一般认为放疗可作为手术后的辅助治疗，可作为肿瘤不能切除或因身体状况不适合手术患者减轻症状的姑息性治疗。对于鳞状细胞癌及腺样囊性癌瘤术后辅助放疗剂量一般为60Gy，对于肉眼残留的肿瘤，放疗剂量应增加至68～70Gy。气管内的近距离放疗可能是治疗气管肿瘤的合适方法，使用60 ~68Gy的外照射放疗后使用8 ~15Gy的近距离照射可以提高局部控制率。
2、内镜下治疗：对于肿瘤不能切除或因身体状况不适合手术患者，可以使用内镜对气管腔内肿瘤进行姑息性切除。肿瘤的局部处理可以使用活检钳并吸引器处理，行电凝治疗、冷冻治疗、激光治疗、光动力学治疗或氩气凝固治疗。然而，使用此法难以达到根治。
3、气管支架置入术：在肿瘤不能切除或身体不适合手术的患者中，可以使用硅树脂或自膨支架对80% ~90%的患者进行姑息性治疗，支架有不同的形状与型号能够适应不同位置的肿瘤所导致的狭窄。