在胃镜检查过程中以及胃镜检查后，患者可出现腹胀、腹部隐痛等不良反应，一般在嗳气以及气体进入消化道深处后，症状即可达到明显的缓解，术后数小时或1-2天之后上述不适症状可消失。
胃镜检查是协助明确上消化道疾病的重要检查手段，通过胃镜检查可以直观并清晰的观察到患者的食管以及部分十二指肠黏膜，协助诊断慢性胃炎、消化性溃疡病以及食管、胃肿瘤等疾病。在进行胃镜检查过程中，如发现明确病变还可通过活检钳钳取病变组织送病理学检查，以协助病变性质以及严重程度的判定。胃镜在通过患者的咽部时可刺激咽喉壁以及会厌，造成患者出现恶心、干呕、呛咳等不良反应。在胃镜检查过程中，胃壁具有一定的皱褶以及皱襞结构，需要注入一定数量的气体使胃腔扩张、皱襞平展，以便于观察病变。
胃镜检查结束后半小时内患者不要喝水、进食，术后需2小时后进食温凉的流质饮食，如米汤、菜汤等，并禁止吸烟、饮酒、喝浓茶、浓咖啡。检查后24小时内不可做剧烈运动，应结合身体的实际情况适当休息。