乙脑灭活疫苗可有效预防乙型脑炎病毒感染引起的流行性乙型脑炎，由于是死病毒制成的疫苗，不良反应率低。乙脑灭活疫苗注射后一般无不良反应，个别可出现发热、皮疹、头晕、注射部位疼痛及出现硬结等不良反应，一般都能自行缓解。发热是一过性的，以低热为主，一般不超过两天可自行缓解。皮疹症状大多比较轻微，一般不需特殊处理，具体症状可用炉甘石洗剂防止瘙痒症状，抗生素防止继发感染等。