口服紧急避孕药可能出现恶心等胃肠道不适，但发生率很低。紧急避孕药的孕激素含量明显高于常规避孕药的剂量，用药一片或两片可造成的一次性血液中激素水平的暂时升高，下降后发生撤退性出血，表现为异常出血，月经提前或下次月经后延。也有可能避孕失败，出现意外宫内孕，或孕激素影响输卵管蠕动，受精卵着床在输卵管内，也是异位妊娠的病因之一。