慢性前列腺炎的临床症状千变万化，往往不具有特异性，诊断也比较麻烦。慢性前列腺炎的诊断，必须靠必要的物理诊断和实验室检查，主要包括：
第一、前列腺直肠指诊，前列腺触诊检查对前列腺炎以及前列腺其他疾病进行临床诊断是重要的手段之一，可以获取准确诊断和指导临床用药不可缺少的重要信息；
第二、前列腺液常规检查，慢性前列腺炎患者前列腺液的细胞学检查，是实验室诊断的常用方法，主要通过检查卵磷脂小体、红细胞、白细胞或者脓细胞的数量，来判断前列腺是否发生炎症及其严重程度；
第三、前列腺液病原体的定位培养与药物敏感试验，准确的细菌培养与药物敏感试验的结果，是直接影响临床治疗效果的重要因素之一，是临床医生选择抗菌药物的重要依据。
此外，对于一些特殊类型和不典型的慢性前列腺炎患者的诊断，可以对排尿情况、尿流动力学、精液分析、前列腺液免疫功能和微量元素进行分析，通过B超以及造影、内窥镜、CT、磁共振扫描等检查，来获取诊断信息。