微波理疗仪的危害主要为以下几方面：
1、如果体内有金属物，或者是表面附着有金属体时，会导致金属发热，从而引起组织的灼伤，包括一些深层次软组织的烧灼伤。
2、如果使用时间过长或者是功率过大，可以造成局部的烧伤而引起疼痛，甚至会引起瘢痕形成。
3、一些凝血功能较差的人，或者是血小板较少的人，如果做微波理疗时间过长，会导致局部出血，甚至大出血，而形成皮下组织血肿。
4、肿瘤患者如果使用微波理疗仪，可能会导致癌细胞的扩散，或者是癌细胞的迅速生长而引起肿瘤的转移。
5、如果腹腔内有一些塑料物品，例如引流管等，可能会导致引流管的脆裂，甚至是断裂而出现一些严重的并发症。
总之该仪器的使用需要在医生的指导下进行。