甲状腺疾病挂什么科室，要看具体甲状腺疾病的类型，通常建议甲状腺疾病可以先选择内分泌代谢病科。
甲状腺属于内分泌腺体，如果出现了功能异常，如甲状腺功能亢进症或者是甲状腺功能减退症，在功能状态的异常情况下，需要进行内分泌专科进行功能调整，同时针对引起甲状腺功能异常的原因，在内分泌科也可以进行相关的检查与治疗。甲状腺在进行影像学检查时，如果发现存在甲状腺结节，对于良性结节，可以定期在内科进行随访，但是如果良性结节体积较大，导致患者出现压迫症状，如出现吞咽困难、呼吸困难时，或者考虑是恶性结节，有甲状腺癌的可能性，建议转到甲状腺外科进行随访。
所以甲状腺疾病通常可以选择内分泌科和甲状腺外科进行随访与观察疾病，对于甲状腺疾病需要内科治疗时，通常在内分泌科完成即可，需要外科治疗时，需要到甲状腺外科进行处理，还有一些甲状腺功能亢进症患者需要进行碘-131治疗，这个时候还需要核医学科来共同治疗。