嗜酸细胞性胃肠炎的并发症包括荨麻疹、肠梗阻、幽门梗阻等。
1、荨麻疹：主要表现为风团和血管性水肿，多半有瘙痒，容易反复发生新的皮疹。病程可迁延数日至数月。
2、肠梗阻: 临床主要表现为腹痛、腹胀、呕吐、肛门停止排气排便。
3、幽门梗阻：患者长期不能正常进食，并大量呕吐，导致严重的营养不良、低蛋白血症及贫血，并有严重脱水、低钾及碱中毒等水、电解质紊乱。