迄今为止，没有任何研究显示，在任何一种医学操作后，减少菌血症的持续时间或频度能够减少操作相关的急性感染性心内膜炎的风险；也没有证据表明预防性使用抗生素确有必要。
目前认为预防急性感染性心内膜炎的最有效措施是良好的口腔卫生习惯和定期牙科检查，在任何静脉导管插入或者其他有创性操作过程中，都必须严格无菌操作。在有先天性心脏病患者有创操作后，建议应用抗生素预防。