先天性食管闭锁的诊断主要以食管造影作为诊断依据。先天性食管闭锁经确诊以后，尽早的进行手术治疗 、纠治畸形。手术前应适当的补液；纠正脱水和电解质失衡的情况；防止吸入性肺炎；给予抗生素进行预防性抗感染治疗，保持体温正常。一旦出现体温偏高等感染的症状，是不能进行手术的，需要先进行控制感染，待感染控制住以后，再考虑手术。