延髓背外侧综合征的治疗原则应遵循缺血性脑卒中的治疗，在溶栓时间窗内且无溶栓禁忌症者应给予溶栓治疗，超过溶栓时间窗者，应给予积极抗血小板聚集等治疗。
一、一般治疗
1、卧床休息，避免头颈部活动和声光剌激。
2、控制眩晕、止吐，减轻患者痛苦和缓解紧张情绪。
二、药物治疗
1、抗凝冶疗：目前临床上常用低分子肝素如速避凝，它保留了普通肝素的抗凝作用，却没有普通肝素的一系列副作用，用药时无需监测凝血功能。
2、降纤治疗：适用于脑梗死发病在6小时内者，但个别患者72小时内纤溶酶原过高，为预防再次梗死，仍可酌情应用，用药前后需监测凝血功能及纤维蛋白原。
3、血液稀释疗法：对确有血黏度高和循环血量不足的患者，适量应用低分子右旋糖酐或706代血浆，以改善其血液循环状态。
4、抗血小板药物治疗：其作用在于降低血小板聚集性和血黏度，常用阿司匹林。
5、脑保护剂治疗：旨在阻断缺氧后脑细胞坏死的不同机制，延长细胞生长能力，促进后期神经元的功能恢复，常用药物有钙通道拮抗剂，如西比灵、尼莫地平及胞二磷胆碱等。
三、手术治疗
溶栓术：最佳治疗时间窗是在发病后6小时内，特别是发病3小时内，对于超过6小时的患者可综合分析多方面条件，根据病情适当放宽溶栓治疗的时间窗。方法是给予尿激酶静滴，之后立即给予20%甘露醇静滴，视病情决定用药时间，一般3～7日逐步停用，可同时给予制酸及胃黏膜保护剂预防出血。溶栓后24小时内不给予抗血小板聚集药，血压过高者可适当服降压药。
四、其他治疗
早期进行系统、规范和个体化的康复治疗，有助于神经功能的早期恢复和病残率的降低，故应早期进行，不要延误。