第三磨牙萌出不全是引起冠周炎的最主要原因，是由于人类在发展进化过程中，食物、生活习惯、咀嚼力的变化使得下颌骨逐渐退化导致。第三磨牙阻生的类型对冠周炎的发生、发展也有一定影响，其中部分萌出的垂直阻生智齿和近中倾斜阻生智齿导致的冠周炎临床上最为常见。萌出不全的智齿与软组织之间多形成深而窄的盲袋，致使其自洁作用差，易藏污纳垢，是细菌生长繁殖的良好条件。正常情况下，人体抵抗力强，不易引起智齿冠周炎。但当人体在感冒、疲劳、睡眠不足等情况使人体低抗力下降，此时细菌繁殖，易导致冠周炎的发生，引起感染。
一、主要病因
1、进化因素：在人类发展、进化的过程中，食物越来越精细，生活习惯也有逐渐的改变，从而引起人类的颌骨越来越小，逐渐退化，致使牙列与颌骨的长度不协调，进而导致人类第三磨牙萌出不全是，这是引起冠周炎的最主要原因。
2、智齿阻生或萌出不足：萌出不全的智齿与软组织之间多形成深而窄的盲袋，致使其自洁作用差，易藏污纳垢，是细菌生长繁殖的良好条件。
3、全身因素：正常情况下，人体抵抗力强，不易引起智齿冠周炎。但当人体在感冒、疲劳、睡眠不足等情况使人体低抗力下降，此时细菌繁殖，易导致冠周炎的发生，引起感染。
4、咬合因素：咀嚼时对龈瓣的机械损伤，使黏膜发生溃烂，破坏了组织的防御功能，使细菌乘机而入，也可引起冠周炎。
二、诱发因素
1、口腔卫生不佳，易导致该病的发生。
2、长期精神压力大、内分泌异常、身体免疫功能低下，感冒、疲劳、睡眠不足等情况，造成人体失调，抵抗力下降，此时细菌繁殖引起感染，形成智齿冠周炎。