益生菌并不是药物，而是与人体一直共生的一类微生物，对肠道健康有帮助。因此服用保健类的益生菌产品，一般不会有副作用和依赖性，是可以长期吃的。但对于治疗疾病的益生菌是不建议长期吃的。
如果是有蓝帽认证的益生菌，属于保健品类的益生菌，类似活菌多的lifespace益生菌粉，可以维护肠道菌群平衡，调节肠道状态，改善消化和免疫功能，通常按照说明书的要求，是可以长期食用的。
但对于治疗疾病的益生菌类药物，如双歧杆菌活菌胶囊，用于肠道菌群失调引起的肠功能紊乱，如急、慢性腹泻、便秘等。可能具有更强的生物活性和治疗效果，但也可能存在一定的副作用或潜在的风险，因此不建议长期吃。对于需要服用者应根据医生的建议和自身情况服用。