扁桃体发炎由于症状的严重程度不同，用药也不同。如果只是有咽喉的不适，可以仅用一些漱口水漱口、口服中成药，比如双黄连口服液，或者清咽滴丸。
如果炎症没有得到控制，咽痛逐渐加重，甚至有吞咽或呼吸困难，最好需要到医院去做进一步的检查，如果验血发现白细胞比较高，则还需要看局部扁桃体充血程度、有没有扁桃体的渗出等。
如果比较严重，一般会用一些抗生素，可以口服抗生素，或者静脉输液。如果暂时不方便或不能及时到医院，可以在不过敏的情况下，口服抗生素，比如头孢拉定、头孢呋辛、阿奇霉素等。