扁桃体是机体免疫器官之一。如果将扁桃体进行切除会给有些后遗症：因为扁桃体是人体的重要免疫器官之一，成年人它的免疫能力就减弱了，其它的例如咽干、淋巴组织代偿增生、手术后遗症等。所以在计划做扁桃体摘除术后，一定要去大医院做正规的手术。如果扁桃体反复发作，同时会伴有一些并发症，危害比较大时，已经严重影响到人的生活质量可以进行手术将扁桃体进行切除，例如，反复的扁桃体炎可能会引发患者全身感染，如心肌炎、肾炎、风湿炎等。反复慢性炎症也是扁桃体癌，恶性淋巴瘤的发病原因之一，所以应该及时切除这一病灶。