引起肛周脓肿的原因很多，婴儿出现肛周脓肿多为男性，考虑出生不久体内雄激素过高加上腹泻导致的。成人常见的原因是也是腹泻，肠镜检查可见结直肠炎、溃疡性结肠炎、克罗恩病，加饮酒吃辛辣食物导致肠道出现炎症反应。稀便可进入肛隐窝刺激肛门腺体，人体抵御细菌能力下降，细菌进入腺体引起感染化脓，向周边扩散就形成红肿热痛的症状。