儿童用阿奇霉素的危害主要在于阿奇霉素会引起胃肠道菌群紊乱，导致呕吐、腹泻、恶心等临床症状。有的儿童对阿奇霉素过敏，会引起全身的皮肤反应，比如皮疹、瘙痒等症状。
如果是注射阿奇霉素，有的儿童会引起注射部位局部炎症、疼痛。有些严重的儿童会导致肝损伤，心电图的Q-T间期延长，以上是儿童使用阿奇霉素的全部危害。如果出现皮肤瘙痒、肝损伤、心电图Q-T间期延长。
那么建议停止使用阿奇霉素，大部分可以停药后会随之消失。如果只是胃肠道反应，建议通过加用益生菌来减轻胃肠道的反应，如果加用益生菌没有缓解，建议停止使用阿奇霉素，改用其他抗生素进行治疗疾病。