窦性心律不齐可以自愈，窦性心律不齐一般出现在青少年人群或者植物神经功能紊乱、睡眠障碍、长期处于压力大、熬夜、精神紧张情况下的人群。严重的也可见于心脏神经症，会引起窦性心律不齐。
这种情况并不属于器质性疾病，大多不需要治疗，一般可以调节生活方式，去除诱因，调节好睡眠，多吃一些富含维生素和B族维生素的食物，比如新鲜的水果、青菜等。去除紧张焦虑，避免熬夜，也避免饮用茶酒咖啡等刺激性物质。如果去除这些诱因，大部分窦性心律不齐可以自行缓解。