抗核抗体阳性见于多种疾病，最常见的是结缔组织病，包括系统性红斑狼疮、干燥综合征、硬皮病、多发性肌炎等等。
在非结缔组织病中也可以出现阳性，比如慢性活动性肝炎、重症肌无力、慢性淋巴性甲状腺炎等等。在一些正常的老年人也可以出现阳性，只是滴度较低。
抗核抗体在临床上只是一个筛选试验，如果自身无明显不适可以随诊观察，如果出现了高滴度的阳性，再出现一些临床症状，比如口腔溃疡、脱发、光过敏、口干、眼干，以及关节的疼痛或者皮疹，有可能合并了自身免疫性疾病，需要进一步检查。