小儿感染性心内膜炎在治疗不及时或发展迅速时可能会并发眼部疾病，严重可能会导致失明，其中以急性感染性心内膜炎所并发的神经系统病变导致的眼部疾病较为常见。因为急性感染性心内膜炎可能会有感染性赘生物迅速增长。其中大的或多量的赘生物可能会堵塞瓣膜口或肺动脉导致急性循环障碍，导致脑血管栓塞或是眼部动静脉栓塞，从而引起眼部病变。若治疗不及时，严重会导致失明。