小儿细菌性肠炎一般首选头孢类药物，尤其是第二代和第三代头孢药物，因为小儿细菌性肠炎多见革兰氏(-)杆菌感染，第二代和第三代头孢药物可兼顾此类细菌。如果是低热的话，首选物理降温，用温水擦浴额部，手心及足心。如果体温大于38.5摄氏度，就要用药物降温，如布洛芬或对乙酰氨基酚滴剂。同时要积极完善病原学检查，再根据大便培养及药敏结果及时调整药物。要补充益生菌，防止水电解质紊乱。