膀胱憩室需要与以下几种疾病进行鉴别：
1、尿道憩室：同样有两段排尿，膀胱造影和排尿性膀胱造影可显示尿道内有囊性肿块，而膀胱内无憩室。
2、输尿管憩室：B超检查可显示在膀胱外存在囊性肿块，排泄性尿路造影或逆行性尿路造影可显示憩室的部位。
3、前列腺增生：典型症状为尿频、排尿时间延长、射程缩短、尿线细而无力，改变体位或增加腹压可以帮助排尿，常有尿不尽感。通过血清前列腺特异性抗原测定或尿道膀胱镜检查相鉴别。
4、重复膀胱：通过B超及CT检査可获取图像，图像显示膀胱有完整的肌层和黏膜，经尿道造影和膀胱镜检查膀胱内有分隔或者是两个完整的膀胱。