医源性胆管损伤的危险因素中，可以有效控制的只能是手术操作方面的问题。因而，医源性胆管损伤的有效预防要从医生角度入手，提高胆囊胆管手术的安全性，从而避免因手术造成的胆管损伤。对于病患而言最好的预防就是避免胆囊等疾患，避免接受相关手术。
（1）医源性胆管损伤的有效预防只能从医生角度入手，主要手段就是通过各种方式来提升胆囊胆管手术安全性来避免胆管损伤。
（2）站在病患角度来讲，避免接受胆囊胆管手术，这样便从根源上切断了医源性胆管损伤发生的可能。但绝对不是要大家在出现必须手术相关疾病时拒绝手术，这样是对自己生命的不负责任。正确的方式是要养成良好的生活习惯，特别是注意避免过多的油腻饮食，从而降低我们罹患肝胆疾病的风险。如此一来，需要手术的几率大大降低，自然也就有效预防了胆管损伤的发生。