阴道闭锁主要通过手术治疗，根据阴道闭锁的类型选择合适的术式，主要有阴道闭锁切开术、子宫颈-阴道贯通成形术、阴道成形术等。阴道闭锁一般需要2周左右的治疗周期。
一、药物治疗
阴道闭锁无需通过药物治疗。
二、手术治疗
1、阴道闭锁切开术：Ⅰ型阴道闭锁者可先用粗针穿刺阴道黏膜，抽出积血后切开闭锁段阴道，排出积血，常规检查宫颈是否正常，切除多余闭锁的纤维结缔组织，利用已游离的阴道黏膜覆盖创面，术后定期扩张阴道以防挛缩。
2、子宫颈-阴道贯通成形术：Ⅱ型阴道闭锁者需评估子宫颈与子宫体发育情况，判断是否适宜保留子宫。若需切除发育明显畸形的子宫，则术中同时行阴道成形术。若保留子宫，由于病人闭锁段阴道往往距外阴较远，应该在术前充分考虑以何种材料进行部夯阴道豁膜组织的替代，如病人大腿外侧皮肤、生物网片等，并考虑好“上下贯通”的方案，将子宫颈-阴道贯通成形。
3、阴道成形术：包括皮瓣及黏膜组织移植法、新鲜羊膜移植法、盆腔壁腹膜代阴道术、乙状结肠移植、Vecchietti牵引术以及生物网片代阴道法。各种做法都要在膀胱与直肠之间分离出一约8cm长的人工阴道，但由于覆盖腔道的材质不同，使得后续阴道的弹性与润滑度有所差异。一般而言，皮肤形成的人工阴道较干涩，新鲜羊膜或盆腔壁腹膜的较柔软而润滑度中等，乙状结肠的较润滑但有时分泌物过多，而生物网片的更接近自然阴道，柔软润滑。目前的生物网片选自脱细胞猪小肠黏膜下基质，生物相容性好，韧性大，手术操作简单安全，术后恢复更快，但费用昂贵。
4、子宫切除术：对于合并手术后不能恢复正常子宫形态及功能者、宫颈成形术后再次粘连者、子宫及输卵管感染者可行子宫切除术。