皮内痣属于色素痣的一种，极少数可发生恶化的色素痣中又以交界痣多见，所以本病通常无须任何治疗措施。但若担心皮肤的异样改变影响美观时，可行手术切除或物理疗法加以干预，以彻底清除病理组织。一般治疗周期大概在15～30天左右。
一、保守治疗
大多数患者的皮内痣可终生保持良性特征，无须治疗，必要时可用化妆品等加以掩盖装饰。
二、药物治疗
此病一般无药物治疗。
三、手术治疗
对于外观要求较高的患者，若感觉面颈部的皮内痣妨碍美观，可行手术治疗以彻底切除痣体，必要时会扩大手术范围切除健康肌肤的边缘。手术可能会留下一定程度的瘢痕，病变范围太大时，也可能需要分次切除。
四、物理治疗
物理治疗可行二氧化碳激光或调Q开关紫翠宝石激光等来治疗皮内痣，操作人员从主观上应尽力避免“过度治疗”，此类疗法创口小，风险较低，但复发率比手术切除高出许多。