窦性停搏的治疗要看病人具体的情况，如果病人偶发的窦性停搏，但是没有心动过缓的相关的症状，这样不必治疗，要定期随诊观察。
如果病人经常有症状频发的窦性停搏，例如病人可能出现黑蒙，或短暂的意识障碍或者是晕厥，严重的病人发生了阿斯综合征，这种情况要接受起搏器的治疗。起搏器的治疗之后，患者如果有心动过速，就可以应用抗心律失常的药物了。因为有起搏器的保驾，心率不会低于60次。
有的病人是有一些原因引起的窦性停搏，例如急性下壁心肌梗死，还有窦房结的变性和纤维化以及脑血管意外等等病变，还有的是应用洋地黄类的药物，或乙酰胆碱等药物，导致的窦性停搏。要改善以上的原因，对症治疗之后，窦性停搏也可能得到改善。