肛周脓肿的手术，临床上有两种手术方式，一种是肛周脓肿切开引流术，另一种称为肛周脓肿一次性根治术。后者与前者比较，其优势是形成肛瘘的几率明显降低。以后者为例，其手术过程如下：第一步，是皮肤消毒。病人取侧卧位或截石位，肛门及其周围会阴部皮肤用碘伏消毒液涂擦消毒。第二步，是切口，在病灶有波动感区域切开，将脓液排出，脓腔内用双氧水、碘伏消毒液冲洗干净。第三步，是挂线，找到脓肿的内口，进行挂线，促进伤口引流。完成手术。