心房颤动药物转律目前主要是普罗帕酮和胺碘酮，普罗帕酮更适用于无器质性心脏病基础的病人，胺碘酮适用于有器质性心脏病基础的病人或者普罗帕酮转律无效的病人。
房颤发生超过48小时，转律前要进行抗凝治疗，转律前要做心脏超声检查，最好是食道超声，明确左房是否有血栓形成，如果有血栓存在，是转律的禁忌症。房颤发生时间不明确，转律前要抗凝治疗，包括华法林或者新型口服抗凝药、低分子肝素的使用。胺碘酮使用前要进行肝肾功能、甲状腺功能以及肺部CT检查，注意药物副作用。