小儿脓胸患儿的治疗需要根据自身状态选择合适的治疗方式，主要包括抗感染、引流脓液促使肺复张、全身支持治疗以及吸氧治疗，减轻患儿呼吸困难等症状，患儿一般治疗周期为2个月。
一、药物治疗
1、抗感染治疗：临床上常先经验性静脉用药，再根据细菌培养和药敏结果及时调整药物和用量。一般以头孢菌素类抗生素为首选，如头孢曲松、头孢哌酮，若产生耐药性则可选用美罗培南，万古霉素，必要时可以再加抗厌氧菌的药物。
2、全身支持治疗：常用氯化钠注射液，葡萄糖氯化钠注射液等迅速纠正患儿脱水，改善血液循环状况，纠正休克。静脉补充氯化钾，葡萄糖酸钙等纠正患儿的电解质紊乱，并补充丢失的钾、钙。
3、激素治疗：如地塞米松、甲基泼尼松龙等，在疾病的早期使用，可以抑制炎症反应，减轻胸膜粘连，帮助退热，减少脓液渗出。
二、手术治疗
1、胸腔积液引流：
（1）胸腔穿刺，在脓胸发生后的前24～72h，于脓液较稀薄，纤维蛋白含量少，可在72h内采取每日穿刺抽脓使肺脏扩张。
（2）如首次胸穿失败，或婴幼儿脓胸不易多次反复胸腔穿刺，或经过胸穿治疗脓液不见减少时，应尽快采取胸腔闭式引流术可防止向慢性转化，必要时可向胸腔内注入适当抗生素，有利于肺部扩张，减少胸膜腔间隙，便于炎症消退。
（3）胸膜腔闭式引流加纤溶酶冲洗，目前指南建议的一线治疗为胸腔闭式引流加尿激酶冲洗溶解纤维蛋白、降低脓液的黏稠度从而更有利于胸腔积液的引流，减少或清除胸膜粘连或间隔的形成。最常用的为尿激酶或链激酶。
2、电视胸腔镜手术：处理时，其创伤小，损伤轻，疼痛轻微，术中清除胸腔积脓和纤维素彻底，能够同时行纤维板剥脱及同时处理诸如支气管胸膜瘘等合并症，术后并发症少，恢复快，对患儿的生长发育影响较小，但电视胸腔镜手术适用于治疗早期，最好确诊脓胸4天内进行。
3、胸膜纤维板剥除术：脓胸进展数周后进入机化期，需选择开胸纤维板剥除术等更为积极的疗法，争取最大限度地恢复肺功能。
三、其他治疗
吸氧：目的是增加氧气吸入，缓解呼吸困难等症状。