1、神经检查：有无视力障碍、视神经盘水肿、眼肌瘫痪、听力减退、吞咽困难、肢体瘫痪、病理反射、肌张力改变、共济失调、不自主动作(震颤、舞蹈样动作、手足徐动)、感觉障碍、大小便潴留、失禁及脑膜刺激征等。
2、一般检查：血、尿常规，血沉，脑脊液压力、常规、生化、细胞学、免疫球蛋白(IgG、IgA、IgM)测定以及血混合玫瑰花环率测定。
3、电生理检查：脑电图、脑诱发(视觉、听觉、体感)电位。
4、影像学检查：脑CT或MRI检查。
5、病毒感染的免疫学检查：用酶联免疫吸附测定法、聚合酶链式反应方法检测血及脑脊液中单疱病毒，取双份血清做补体结合试验、血凝抑制试验以及腺病毒免疫荧光检查、脊髓灰质炎中和试验。
6、脑活体组织检查：免疫荧光检查、病理组织学检查。