性心理障碍有多种表现形式，比如身份障碍等等，原因形成并没有一致的看法，具体如下：
1、生物学方面的原因，有人研究发现人体确实有内分泌的异常或者性染色体的畸变等等。人最初胚胎的时候具有双性的基础，逐渐发育形成了男性或者女性。大多数性心理障碍实际上，现在并没有发现明显肯定的生物学异常。
2、心理因素，在整个的人的发育过程之中，心理发育的某些阶段遇到了阻碍或者挫折。出于父母的引导，有意无意的引导孩子向着异性方向的发展，比如把男孩打扮成女孩也容易造成向异性方向的发展。
3、还有就是社会心理，心理障碍与社会的文化背景有一定的关系。