如果肠道菌群失调，乳杆菌数量下降是由于炎症导致的，针对炎症采取了有效的治疗措施之后炎症彻底好转，乳杆菌可以逐步恢复到正常，同时还要注意营养的均衡，要注意高蛋白饮食，还要注意补充维生素，多吃蔬菜和水果，同时也可以补充一些益生元，可以利于肠道正常菌群的恢复。
此外，也可以多喝酸奶，有些酸奶含有乳杆菌，对于乳杆菌数量的恢复也会起到促进作用。必要的时候也可以口服一些微生态制剂，是含有双歧杆菌以及乳杆菌的微生态调节制剂，也有利于病情的恢复。