新生儿脊膜膨出是因为在胚胎时期出现的发育异常所致，在胚胎期间神经管的发育过程中如果出现后方的椎板没有完全闭合，就会导致出现脊柱裂，这样椎管闭合不全可以使硬脊膜通过缺损位置向外膨出，从而形成囊状的肿物。至于具体引起发育异常的原因，到目前为止并不明确，这有可能与基因的异常有关，也有可能与怀孕期间口服一些药物或者受到一些化学物质的影响、吸烟饮酒等刺激有关系。