霉菌性阴道炎可以选择孕妇可以用的阴道栓剂和洗剂，常用的有硝呋太尔栓剂麦咪康帕、克霉唑类栓剂凯妮汀、制霉菌素栓剂或者泡腾片，还有标有孕妇可以用的中成药洗剂，或者5‰的苏打水外洗。
药物用完一个疗程，需停药几天复查一下，必要时巩固一疗程，孕妇比较容易复发。如果不治疗可能发生逆行感染，导致流产、早产、产褥感染等并发症，影响母儿健康。