巩膜充血的鉴别诊断主要是结膜充血、结膜出血，需要患者引起注意，避免混淆。
1、结膜充血：结膜充血多是由于结膜炎或结膜外伤导致，结膜血管充血一般没有疼痛感，位置比较表浅，用手推动眼球时可见充血的血管可发生轻微的活动，而巩膜充血的血管则不能推动。但是，很多疾病会导致巩膜和结膜共同充血，难以简单进行鉴别；
2、结膜出血：结膜出血是由于结膜小血管破裂出血导致，眼红为鲜红色，无任何症状，通常是照镜子或者被亲朋好友先发现。眼红常为小片状，其他部位眼白完全正常，不伴有疼痛、流泪、怕光和视力下降。多不需要任何治疗。