新生儿败血症的临床表现多样，部分早发型败血症患儿临床表现不典型，尤其是早产儿，出生时无明显症状，但很快出现休克、弥散性血管内凝血以及死亡。晚发型败血症症状不典型，可延误病情。
1、全身症状：发热、体温不升、反应差、喂养差、水肿，Apgar评分(新生儿评分)低。
2、消化系统：黄疸、腹胀、呕吐或胃潴留、腹泻及肝脾肿大。
3、呼吸系统：呼吸困难、呼吸暂停、发绀等。
4、循环系统：面色苍白、四肢冷、心动过速、过缓，皮肤大理石样花纹、低血压或毛细胞血管充盈时间＞3秒。
5、泌尿系统：少尿或肾功能衰竭。
6、血液系统：贫血、血小板少、出血等。
7、中枢神经系统：易合并化脓性脑膜炎，表现为嗜睡、激惹、惊厥、前囟张力及四肢肌张力增高等。