原发性三大神经痛的病因和发病机制目前尚不明确，目前主要与下列两种机制有关（1）三叉神经痛是由于微血管压迫三叉神经感觉根入脑干断所造成，而微血管压迫的原因主要是由于动脉硬化之后引起血管弹性变差，同时使血管变长或扭曲。（2）另外一种原因认为三叉神经根可能受到刺激，比如血管压迫之后会造成节段性兴奋增高，导致三叉神经核团过度兴奋，出现三叉神经痛。继发性三叉神经痛可由三叉神经部位的肿瘤，炎症，血管病等引起。