先天性眼球震颤病因复杂不清，故目前治疗的重要目的是改善代偿头位、减轻眼球震颤，而无法从病因上解决问题。可采取光学治疗，包括屈光矫正、三棱镜治疗，部分患者可通过手术治疗。
一、药物治疗
可应用加巴喷丁和美金刚治疗先天性眼球震颤，但长期疗效、副作用等尚待进一步观察。
二、手术治疗
1、中间带移位术：目前常用的是改良的Kestenbaum-Anderson中间带移位术，即通过眼外肌截退术将中间带移至正前方，改善和消除头位。
2、水平直肌大量后徙术：此术式主要用于无集合抑制和代偿头位的眼球震颤患者，可减轻眼球震颤程度，部分患者黄斑中心凹注视时间延长，视力提高。
三、其他治疗
1、屈光矫正：麻痹睫状肌验光后，如有明显屈光不正，应配镜矫正。
2、三棱镜：先天性运动性眼颤配戴三棱镜，可矫正代偿头位、增进视力。
3、肉毒杆菌注射：可减弱眼外肌的肌肉力量，使近、远距离原眼位眼震有所减轻，视力、代偿头位及视功能有所改善。
4、硬性角膜接触镜：镜片随着眼球的运动而移动，从而提高矫正视力。