小儿房间隔缺损的症状主要取决于房间隔缺损的大小、左向右分流量的大小以及有无合并其它畸形。一般来讲，缺损较小，分流量较小时患儿极少有不适表现。当分流量大时，患儿会出现生长发育差，容易患肺炎且抗感染时间较长才能愈合，活动耐量不如同龄的孩子，或者在玩耍、哭闹时出现呼吸困难，口唇紫绀等症状。合并其它心脏畸形时，产生症状较早且较重。