大动脉错位的手术并发症很多，手术成功率较低，在成功的手术患者中紫绀消失，心功能恢复，肺动脉高压降低，主动脉骑跨解除。至于低心排出量综合症，肾功能不全，术后出血，毛细血管渗漏综合症，左心室流出道梗阻，右心室流出道梗阻等都是手术中或者手术后的并发症，要么克服了并发症患者活了下来，要么术后一段时间内死亡。所有手术成功者，术后恢复好，发育良好，没有后遗症。