鼻中隔穿孔的症状根据穿孔的部位，大小，病因而有所区别。如果说鼻中隔穿孔的面积比较小而且位于鼻中隔前端，可于呼吸时产生吹哨音，如果说穿孔部位位于鼻中隔后端的情况下，可能没有明显的临床不适症状。当然如果说穿孔面积比较大，可以伴有鼻塞，鼻腔异物感，干燥感或者是鼻出血等鼻黏膜萎缩的症状。如果是由于梅毒或者是结核等引发的感染所导致的穿孔，常伴有臭味的脓液。