肾压迫性萎缩的原因是由于肾积水，肾积水是指尿液由肾脏排出受阻，在肾盂、肾盏内滞留的尿液超过了正常容量，肾盂内压力增高，导致肾盂扩张和肾实质的压迫性萎缩，最常见的引起肾积水的原因如下：
1、先天性的肾盂、输尿管狭窄；
2、输尿管的结石和肿瘤；
3、下尿路梗阻性疾病，如前列腺增生、尿道狭窄、神经源性膀胱等。
如果肾积水不能及时解除，导致了肾实质受压、萎缩，最终也会引起肾功能不全的发生。