临床上慢性头疼的原因包括偏头疼，也就是反复或周期性发作的一种，可以累及到偏侧或者全头疼，通常的病因是与颅内的血管痉挛或者是微栓塞的机制有关系，大约2/3以上的偏头痛患者是女性，年轻时就可以发生，随着年龄的增加可能有一定的好转。
再有是紧张性的头疼，紧张性头疼通常表现为头部的一种紧箍的感觉，或者后颈肩部发紧，这种多数与局部的肌肉紧张，比如受凉或者是姿势不良而导致的头疼，还有经期头疼，在经期由于激素的变化可以诱发偏头疼。